国家无线电管理机构，即工业和信息化部，是无线电频率使用许可的实施主体，只有国家无线电管理机构明确规定可以由省、自治区、直辖市无线电管理机构实施许可的，才由省、自治区、直辖市无线电管理机构负责。例如部分800MHz频段集群系统频率、部分150/400MHz对讲机频率等。此外，国家无线电管理机构分配给交通运输、渔业、海洋系统（行业）使用的水上无线电专用频率，由所在地省、自治区、直辖市无线电管理机构分别会同相关主管部门实施许可；国家无线电管理机构分配给民用航空系统使用的航空无线电专用频率，由国务院民用航空主管部门实施许可。